Ну, не совсем так. Обратный расчет будет, но не ранее установленного ограничения. Но они ведь к этому и стремятся - не перерассчитывать "старые" периоды.

В принципе, можно реализовать и более осторожный вариант - навесить свой обработчик, который будет разрешать или запрещать такие изменения с учетом конкретных требований организации. Скажем, отпуск по уходу за ребенком можно будет ограничить, а другие отсутствия - нет. Перерасчет запуститься только с разрешенной даты.
Если реализовывать такой обработчик, то описанную галочку нужно снять, иначе до этого обработчика дело даже не дойдет.

Очень интересная мысль. А обработчик на что навешивается? Где покопать?

На сколько я понимаю, есть разные пути. Самый простой - user-exit ZXPADU02, вызывается он из ФМ EXIT_SAPFP50M_002 (можно посмотреть параметры, с которыми можно работать). Сработает этот ФМ при валидации записи ИТ (когда ENTER жмешь).

Получается нужно проверить ИТ на 2001 (ФМ вызывается для всех ИТ). Если это запись нужного подтипа, то пропускаем, ничего не делаем. Для остальных подтипов воспроизвести стандартную обработку - определить глубину перерасчета по ЕдРасчета и ИТ0003, и если изменение происходит раньше, не позволять это делать.

Изменяя только дату окончания у вида отсутствия выходит сообщение, что изменения запрещены "Изменение до СамРанДаты ОбрРасчета 01.01.2013".