Здравствуйте!
Подскажите, пжл, как найти даты доработок транзакций FI01, FI02, FI06, доработаны с помощью каких-то расширений. Через se80, Улититы, Версии они не видны.

Транзакции, обычно, не дорабатывают. Дорабатывают программу, которую вызывает эта транзакция.
А, так как могут доработать используемые этой программой другие объекты, то просматривая программу, вы изменений не увидете.
Найдите по документации стандартные места расширений для этого функционала и проверьте их.
Поищите, на форуме много раз обсуждали, как искать точки расширения через отладчик.
Напишите, что поменялось в работе функционала, это может помочь идентифицировать проблему.