При сохранении технологического заказа для компонентов с типом позиции "N" формируется заявка с типом NB (стандарт). В группе ППМ материала прописан особый вид документа для заявок.
Так же среди компонентов присутствуют позиции типа "L" для данных материалов настроены свои группы ППМ со своим видом заявок.

Как настроить, чтобы формировались заявки нужного вида под материалы с разными группами ППМ и своими видами документов?

Что-то не понятен вопрос: вид заявки для нескладируемых позиций - OPJP.
Виды заявок для групп ППМ - OPPR.

Так вот попробуй теперь создать заказ с позициями L и N с разными материалам, у которых разные группы ППМ и для которых настроены разные виды заявок, и посмотреть какого вида будут заявки - все будут вида NB.

А нужно чтобы вид заявок был в соответствии с тем, что настроено в группе ППМ.