Отрицательные элементы затрат в дифференциации материалов после расчёта регистра.
Как бороться и откуда они могут взяться?

Могут появиться, если используются переходящие заказы (есть НЗП на заказах), плановая и фактическая дифференциация видов работ отличаются и стандартная цена после периода запуска заказа изменялась через плановую калькуляцию.
Это связано с тем, что работы в НЗП уходят по плановой дифференциации, а в выпуск - по фактической того периода, когда работы были отпущены. Выпуск изначально осуществляется по дифференциации стандартной цены периода выпуска, а потом дооценивается работами, ушедшими в выпуск из НЗП. При этом из дифференциации выпуска вычитается плановая дифференциация видов работ периода возникновения НЗП и прибавляется фактическая дифференциация видов работ, ушедших в выпуск того же периода. Может получится так, что в дифференциации стандартной цены периода выпуска сумма элемента может быть меньше, чем в вычитаемой плановой дифференциации вида работ, ранее ушедшего в НЗП, а в фактической дифференциации сумма может быть недостаточной чтобы элемент стал положительным.

Спасибо, а ещё возможные варианты?

Ситуаций из-за которых это может возникнуть полно:
1. если вы используете выпуск побочного продукта 531ВД, 262ВД или аналогами, то сумма такого выпуска записывается в минус соответствующего элемента.
2. то же самое делаете по МВЗ каким-нибудь 202ВД, например приходуете отходы.
3. сторнируете списание работ предыдущего периода в текущем (сторно проходит по стоимости тарифа предыдущего периода, а расчет использует дифференциацию периода ввода сторнирования).
4. в течении периода меняете плановый период и отпускаете работы по разным плановым периодам...
5. в конце концов погрешности округления помноженные на количество выпуска могут давать тоже свои варианты (обычно незначительные).

Тут еще не плохо бы знать, а не ведется ли у вас расчет фактического тарифа в регистре материалов - в этом случае свои заморочки могут быть другими...

К сожалению нет, нет, нет и ещё раз нет.
А вот про тариф в регистре можно подробней, что имеется в виду?

опишу подробней.
открываю ckm3n
вижу:
начальные запасы = 0шт
поступление = 1шт
производство = 1шт значение = 300
вариант изгт 10
поступл.из пред.уров 50 (в разбивке по элементам попадаются отриц)
позаказный расчёт затрат -10 (здесь тоже)
потребление = 1шт значение = 300
итого = 0шт

отрицательные суммы в элементе, куда присвоены виды затрат работ?

Коллеги, у меня схожая ситуация - отрицательные суммы в дифференциации по элементу "сырье".
Настроено комплексное производство, НзП как совместно-производимый, схема распределения затрат между готовой и незавершенной продукцией. Расчет заказов - по стандарту (KSII, CON2, KO88). После расчета регистра около 30 ОЗМ ( и ГП, и НЗП) за период имеют отрицательные суммы по "сырью".
Подскажите, что смотреть/проверять, чтобы уйти от отрицательных сумм.