По стандарту в СOPA по калькуляционному методу не тянется по счет-фактуре SD (вид операции F) валютный курс KURSF = 1. По всем остальным бизнес-операциям (например, прямая проводка из FI) тянется.
В COPA активирован учет по Валюте БЕ (USD) и Валюте ЕУР (RUB). Соответственно при счет-фактуре SD валютный курс по одной из валют (в зависимости от валюты заказа клиента, например, заказ клиента в рублях, значит позиция по типу валюты БЕ имеет валютный курс не равный 1) внутри COPA перерассчитывается по типу курса M.
Нужно, чтобы валютный курс KURSF = 1 и код иностранной валюты FRWAE = валюте (типу валюты БЕ или ЕУР) по позиции.

Может нота есть?