Каким д.б. заказ клиента, чтобы на него можно было отправить работу ручным перерасчетом? кто-нибудь это пробовал?

А в чём проблема? Открывайте заказ клиента и позицию для ввода в перерасчёте работ в качестве носителя затрат.

система видит сам заказ, но не видит к нему позиции - хотя формально они есть. проблема в СО и СД?
не понятно - мне интересно, вообще чисто теоретически, возможно ли в 4.7 отправить работы на заказ клиента, без доп.контировки на объект контроллинга или нет если кто-то делал, дайте отмашку, что можно, буду "рыть" дальше )

Можно, можно. В данном случае заказ клиента есть носитель затрат.

Можно, поставьте галку на sales orders в настройке КЕ