Проверьте, пожалуйста, что все ноты по этой программе установлены, в свое время SAP исправлял массу ошибок (правда, при этом делал новые, которые потом также исправлял )
Далее отфильтруйте отчет по номеру материала в целом, посмотрите, нет ли в отчете строк с отрицательными значениями, которые и привели к увеличению запаса (если где-то убыло, значит где-то прибыло, хотя к оборотке это в меньшей степени относится )

Исходя из того, что Вы написали выше (в мае отпуск, поступление в июне, но запас в мае уже увеличился, как я понял, на принимающем заводе), тогда можно сделать вывод, что в отчете очередной косяк. Но на всякий случай проверьте, что все операции выполнены именно так, как Вы их трактуете.

И еще один момент, раз Вы смотрите по виду оценки...
При двухшаговом перемещении запаса запас на принимающем заводе (или в принимающем сегменте запаса) увеличивается в тот же момент, как выполняется отпуск с отпускающего завода (или отпускающего сегмента запаса), только запас будет числиться "в пути".
Т.е. по виду оценки на принимающем заводе запас действительно должен увеличиться в мае, только он будет не на складе, а в пути. А на складе увеличение запаса должно случиться уже в июне с одновременным сокращением запаса в пути.
Т.ч. посмотрите еще внимательнее на строку, где запас увеличен: склад там есть или нет?