Добрый день!
Подскажите пожалуйста, есть ли стандартное средство, которое
посчитает кол-во праздничных дней в период отсутствия, напр.отпуска, они не должны учитываться при подсчете календарных дней для средней зарплаты в календарных днях,
И нет ли чего -нибудь , которое распознает выходные дни между
различными отсутствиями?

Правила подсчета отсутствий посмотрите
Управление временными данными-Регистрация и управление временными данными-Отсутствия-Каталог отсутствий-Подсчет отсутствий-Правила для подсчета отсутствий (нов.) и вокруг