Здравствуйте.

В расчете ЗП есть функция RUFUP, которая обрабатывает таблицу OFUP.

Что за отсутвия попадают в таблицу OFUP? как-нибудь можно настроить чтобы отсутсвия введёные в декабре 2012 года не попадали в эту таблицу?

Функция обрабатывает отсутствия (отпуска), попадающие на будущие периоды. В том числе для того, чтобы верно сформировать проводки для НУ, в котором, если не ошибаюсь, списание производится не в месяце выплаты, а в месяце наступления события. Этим разбиением в FUP отпуск делится на календарные месяца, и начисленные суммы пропорционально по этим месяцам раскидываются, со сплитами на FUP. Настроить нельзя, только хардкодить правило, жестко прописывая месяц. Что конечно некрасиво, но у Вас задача исходно странная, ИМХО.