какие во индексировать при определении среднего заработка - определяется настройкой в таблице t51av_b (точное название поля не помню, но что-то связанное с "правило индексации". Сами правила индексации прописываются в таблице t51av_c и t7ru51av_c). Здесь в настройке прописывается из какого во брать ставку для индексации. Далее и при расчете коэф-та индексации сравниваются эти ставки: после глобального повышения и в анализируемом месяце расчетного периода. Причем ставка при анализе прошлых периодов берется из уже расчитанных прошлых периодов. Как правило, во в котром хранятся ставки - /010, правило в котором он формируется - ruin (или ru1n... блин, забыл...).
Во-первых, нужно изменить настройку правила индексации - прописать там другой во. (Можно прям ru** - ничего старшного, думаю не забудете при патчах об одной строчке) и реализовать формирование этого во как вам нужно в схеме для последующих периодов
После этого для уже расчитанных периодов 2 варианта:
- писать коррсхему для прошлых периодов и формировать там новый во, в котором будет правильная ставка
- после изменения настроек и реализации формирования нового сравнительного во пересчитать всех за 12 месяцев до регулярного расчета, то есть с 07.2012, если не боитесь пересчетов через год
А вообще,

hr433. Там все подробно описано, что редкость.
И еще. То, что вы собираетесь делать - незаконно. При расчете коэф-та индексации должны сравниваться оклады или тарифные ставки установленные по трудовому договору.
Если до перевода у работника в тд прописан мрот, а после больший оклад, то будьте добры сравнивать их.
Если же там нормальный оклад и до, и после повышения, то подход к проблеме должен быть иным: вам не мрот с мротом сравнивать надо, а оклад с окладом.