Мне кажется, что некорректно удалять весь SOURCE_PACKAGE. Правильнее DELETE SOURCE_PACKAGE index sy-tabix если в цикле. А проще DELETE SOURCE_PACKAGE WHERE /bic/zdelflag = 'X'. Как-то так. А что там с фильтрами вам не понравилось?

С фильтрами наоборот понравилось.
Delete в цикле (без указания индекса) удаляет одну строку итерации, на сколько я помню.

Да, вы правы в loop указание индекса необязательный параметр:
DELETE <itab> [INDEX <idx>].
Here the line with the specified index will be deleted. We can use the same statement without INDEX addition within a loop. That time it will delete the current line.