При настройке BSC можно как нибудь отображать кварталы а не месяца??

Можно.
если не ошибаюсь, для этого есть транзакция umc_tm (в версии 3.0b по крайней мере). там создаются собственные периодизации и временные переменные.
а затем, при определении полей значений, выбрать периодизацию (по кравталам, например).

Пробовала не помогает все равно отображает все месяца с той лишь разницей, что ставит одни и теже значения вмесяца принадлежащие кварталу

Создайте свой вариант финансового года с четырьмя периодами, эквивалентными кварталам, и используйте его.
И будет вам счастье

и агрегацию по кварталам там же (в настройках полей значений) выставляла?