При расширенной проверке получаю сообщения, что ФМ
WS_FILENAME_GET, WS_QUERY являются устаревшими. Насколько я понимаю это означает, что в будущим они могут быть убраны из SAP.
Если ли какие подобные ФМ, но не устаревшие или использовать
CL_GUI_FRONTEND_SERVICES=>FILE_SAVE_DIALOG

GUI_FILE_SAVE_DIALOG тоже устарел?

"Устаревший" для ФМ означает лишь то, что его функциональность более не поддерживается и в дальнейшем обновляться и совершенствоваться не будет. Никто из системы, конечно, ничего удалять не будет.

Ну разве что доживете до версии какой-нить 8-9 тогда может быть и удалят... а так да, пользйтесь только одно но, для гуевых фронтэнд функций может быть такая штука? что к примеру будут проблемы в работе с новыми GUI-клиентами.