Хочу поюзать стандартные FMник в котором или очередь сообщений или возврат ошибок. Останавливаю сообщения MESSAGES_STOP и эта зараза мне поднимает последнее сообщение которое до этого собралось. Как это можно предотвратить?

Перед вызовом запомните содержимое SYST-MSG*.
Вставьте при вызове ФМ
EXCEPTIONS
others = 1.

Скорее всего сообщение выдается в ФМ мимо лога. В этом случае стоит в exceptions добавить исключение error_message. После такого исключения в sy* будут параметры сообщения

Посмотри код ФМ

Удав Ага. осознал ошибку.