Ситуация такова. Создали в табличке Oracle индекс, в словаре индекс не создали, будет ли этот индекс рабочим и убыстрит ли он выборку данных или ничего не изменится или наоборот всё будет плохо?

На сколько себе представляю, в этом случае использование такого индекса для выборки данных будет аналогично индексу, заведённому через словарь, но без возможностей, доступных словарному (транспорт, версии и др.)

уже плохо, потому что вся информация об индексах храниться в саповских таблицах.
скорее всего база индекс использовать будет, но вот при просмотре планов запросов из сапа наверняка будут баги
передалать!

Есть ключ к таблице на уровне словаря. Есть соответствующий ему индекс в Oracle. При обращении к таблице иди последовательное считывание и очень долго, т.е. скорее всего выборка идет не по индексу. Похоже что нет связи индекса R/3 и индекса Oracle (были сбои в системе). Как кзнать наличие этой связи и что можно сделать вообще?

собрать статистику по таблицам
в st05 оттрасировать запрос и посмотреть план его выполнения. если индекс не используется, то либо он плохой либо сап его не знает.
можно попробовать хинты. как пробовать была ссылка

никаких проблем не будет, за исключением того, что администратор будет получать варнинг при checkdb, но это фигня.

Более того, бывает индекс иначе и не создашь, если с таблицей идет активная работа. Сапец не умеет создавать индексы в оракле "онлайн"

Собрать статистику опять таки саповскими средствами не удастся нормально.

и оракелу пофиг на то, знает ли сап об индексах или нет. Решение принимает Oracle CBO