При обработке входящего IDOC делаю:

Далее в BADI для документа материала делаю

Все ОК.
Но, когда приходит около 30-40 айдоков за период в несколько секунд, в 2-3 документах материала данные не из его айдока, а из предыдущих.
Как будто бы не всегда чистится память.
Как такое может быть и как можно это исправить?
Попробовать SHARED MEMORY ?

Я отказывался от передачи через память и протягивал нормально данные по цепочке вызовов путем расширения структуры imseg.

А вы что, один идентификатор для области памяти используете?
Так как обработка IDOC может идти параллельно, то при обработке каждого IDOC необходимо использовать свой идентификатор.

Но лучше прислушаться к совету LKU.