Как только по заказу создается первая фактура - в заказе закрывается расчет цены. Рулется ли это с помощью настройки ( открыть расчет цены) или же это жестко в коде?

Насколько я понимаю, такова идеология системы:
Схема расчета цены из заказа переходит в (последующий документ) фактуру. И смысла менять ее в заказе просто нет -- финансовые провдки выполняются по фактуре.
И если уж очень хочется что-то исправить в расчетах цены, то можно:
или: сторнировать фактуру и расчет цены в заказе откроется
или: попытаться изменить расчет в самой фактуре...