Здравствуйте!
Ситуация: В новой системе предполагается начать работу с 01.07.2016.
Пожалуйста, подскажите -- в чём смысловая разница между указанием в качестве даты переноса "30.06.2016" и указанием "01.07.2016"?
Какая дата будет правильной?

А расчет амортизации Вы с какой даты ведете? Последний день месяца "закрывает" все операции по ОС в данном месяце, первый, соответственно, их открывает. Вы как хотите перенести "закрытые" данные или "открытые"? Лично я предпочла бы последний день месяца. Пересчитывать меньше. Но решать Вам.

"А расчет амортизации Вы с какой даты ведете?" -- в карточках планируем указывать 01.07.2016-го, а дату начала амортизации (тр. SM30, ракурс ZV_T093D ) -- "06.2016", если правильно вас понял.
"Вы как хотите перенести "закрытые" данные или "открытые"?" -- пожалуйста, расшифруйте парой слов, а то пока не совсем сориентировался. Имеется в виду, что в старой системе больше не будет движений?

Да я имею в виду что в старой системе и операции и амортизация все проведено и больше никаких не будет.

Да, планируется, что в старой будет всё проведено и больше никаких проведений не будет, и эти окончательные данные из неё будут взяты и загружены в новую систему.

Тогда и грузите на конец месяца чего думать-то!