При счет-фактуре проводка по кредитору + предварительный НДС отражаеться в одной БЕ а затраты соответственно без НДС в другой. Но вот автоматические проводки по 79 счетам формируються с ошибкой
Строка основн. счета без кода налога в документе
$2 с отсроч. налогами

Т.е по второму 79 не копируеться код НДС. Система не сохраняет такой документ. Налоговые категории проставлены в 79. Что еще можно сделать.

т.е. Вы для документа:
Д32 К60
Дндс

хотите Д32 хотите в одной БЕ а Дндс К60 в другой???!!

да

А можно пример проводки, которую Вы хотите сделать?

Насколько я знаю, с точки зрения методологии учета, в обособленном подразделении нужно делать проводки (например):
1) задолженность
Д 10, 25, 26... 100 рублей
Д 19 - 18 рублей
К 60 - 118 рублей.

2) передача задолженности на оплату в Головной офис
Д 60 К 79 - 118 рублей -обособленное подразделение
Д 79 К 60 - 118 рублей - головнойофис

3) передача НДС вголовной офис - такая же логика.

Обычно используют транзакцию F-51 "Внутренний перенос с выравниванием" (в рамках одной БЕ). Врамках двух БЕ, думаю, надо использовать стандартные транзакции.

Проводки

1 БЕ
Д-Т 79 100
К-т 60 118
К-т 19 18

2 БЕ
Д-т 35 100
К-т 79 100

Закупка центализованных услух для другой БЕ.

Не понятно почему так

По идее проводки должны быть такие
БЕ1
оплата за услуги
Дт60 Кт51 118

БЕ2
оприходование услуг
Дт35
Дт19
Кт60 БЕ1
при этом автоматом К79 БЕ2
Д79 БЕ1