При вводе наименования кредитора в таблицу LFN1 пишется только 35 символов, а полностью (40) только в таблицу адресов.

Не могут ли потом косяки вылезти по этому поводу, может лучше только по 35 заполнять?

В платежку вроде все 40 тянутся.

Вы уверены, что подтянулись все 40? Обычно последние 5 символов обрезаются.
Если имя >35 символов используйте поля имя2 и т.д.

Точно все.

Через настройку сообщений можно разрешить пользователям вводить по 40 символов в эти поля (и тогда действительно полное наименование сохраняется в адресных данных). Но это крайне не рекомендуется (наступали не раз на эти грабли).