Можно ли при использовании планов ТОРО создавать заказ с присвоенным ему сообщением использую стандарт?

Можно.
Плану присваивайте вид заказа ТОРО, который интегрирован с сообщением.

Это единственный вариант?
Т.е. у двух разных планов с одним и тем же видом заказа не может быть ситуации что в первом только заказ, а во втором заказ + сообщение.

мы делали разработку чтоб не делать новый вид заказа

Немного не понял Ваш вопрос.
Для вида заказа определяете создавать с ним вместе сообщение или нет. Для планов где нужен только заказ в качестве отзыва - присваиваем вид заказа без интегрированного сообщения, где нужны и заказ и сообщение - присваиваем интегрированный..
Зачем Вам обязательно использовать один вид?

А что плохого в создании нового вида заказа?

Ничего плохого. Просто логически у нас были виды заказов по видам работ. И был, например, "Заказ ППР". И дабы избежать вопросов а что такое "Заказ ППР1" и "Заказ ППР2", решили сделать маленькую разработку.

А разработка нам бы все равно потребовалась, т.к. мы еще синхронизировали даты межд заказом и присоединенными сообщениями.