Какие существуют способы перенести единицы оборудования из одной системы в другую, возможно ли организовать перенос структуры тех. мест с привязными к ней единицами оборудования, спецификациями.

Через ALE, вроде не получается - нет там таких объектов, поэтому совсем просто не получиться.
Наверно, самое оптимальное - это через IDoc или LSMW.

Еще есть транзакция IBIP, как пользоваться здесь толково написано: http://sapboard.ru/forum/viewtopic.php?t=18489