Где можо отключить № сообщения CJ003 если вообще возможно

а нужно ли? =)
просмотреть в каких программах используется сообщение - SE91

Скажу просто - отключить невозможно. Все вызовы этого сообщения жестко прошиты в коде.
И это правильно. А то как же без проекта то? Исключением, наверное, является его использование в транзакциях составления бюджета и планирования, где оно используется как информационное.