Дано: главная программа в которой имеется N includes. В одном из них находится DEFINITION и IMPLEMENTATION самописного класса. При этом он хмм инклудится в другой include где и используются методы описанного класса - то есть класс упоминается только в этих двух инклудах и больше нигде. При проверке синтаксиса ругается на инклуд с определением и реализацией класса и пишет что: a class already exists with the name '...'.

В чем дело неясно - возможно кто-то сталкивался?

Как же неясно если вы сами написали - При этом он хмм инклудится в другой include - т.е. Вы дважды декларирете одно и то-же - в данном случае класс. Это недопустимо, пэтому и ругань. Переделывайте состав инклюдом.
PS: это вам не С/С++

Разве уровень вложенности инклудов в абапе как-то декларируется? О_о

Нашел ошибку свою - строка INCLUDE XXX автоматически добавлялась в конец основной программы - убрал и все заработало

Да нет, не декларируется.
А описание проблемы я понял как:
...
include A.
include B. " внутри есть include A.
...
Что собственно и было:

Здравствуйте.
У меня похожая проблема. Скопировал инклюд в нашу функциональную группу.
Никаких записей о вызове этого инклюда нет, в том числе в главной программе.
Тем не менее, при попытке активировать функциональную группу возникает ошибка, что как будто все объявляемые в инклюде формы уже объявлены. Как это можно решить?
Заранее спасибо.

Смотрите Вашу группу функций, советую через se80. Где то Вы задвоили значит декларирование переменных.

Нашел источник. Спасибо!
Причина была та же, просто невооруженным глазом не видно, что нужно искать в главной программе функц.группы