Добрый день!
Требуется чтобы цена продажи закупленного материала вычислялась как цена последнего поступления (по фактуре)+ наценка %.
Возможно реализовать стандартными средствами?

При расчете продажной цены можно определить несколько вариантов расчета закупочной цены - так называемая "Последовательность определения ЗЦ". Одним из таких вариантов является "Собственный ФМ пользователя", а в нем уже можно реализовать любой нужный алгоритм.

А кроме своего ФМ какие варианты еще есть?

Без абапа вряд ли обойдетесь.
Функциональность "калькуляция цен", про которую написал dim(ka) используется в Retail.
В вашем случае можно и стандартныс функционалом схемы калькуляции в сбыте обойтись.
Для подтягивания последней закупочной цены написать формулу (абап), а уж наценку настроить стандартом.