Стандартная ситуация: при поступлении проводка: Д BSX K WRX, регистр. с/ф: Д WRX К 60(поставщик).
т.е. операция поступления материала, счета в два этапа. Вопрос: Можно ли настроить в один этап? Например, поступление без проводки, а регистр. с/ф Д BSX К 60(поставщик). Какие могут быть варианты?

можно, но только для услуг и расходных(нескладируемых) материалов.

Именно, т.е. в качестве счета по дебету обычно выступает некий счет затрат.

Можно делать с помощью контированного заказа на поставку (без галки "Поступление материала"), как вариант - с позицией лимита (для нескладируемых материалов или услуг, закупаемых регулярно в течение периода времени). Также можно использовать заказ вида FO (со сроком действия).