какие бывают варианты настройки налогов?

1. Поставляемый в составе российского Add-on и поддерживаемый SAP CIS.
2. Рукописный на собственный страх и риск (видел разные варианты)

Надо вообще-то конкретизировать какие именно налоги имеются в виду - транспортные, НДС, на прибыль и т.п.

а он строится на основе данных бухучета? или параллельно?

См.сообщение от Manticore, т.к. ответ на твой последний вопрос зависит от того, о каком налоге идет речь.

НДС, налог на прибыль, налог на недвижимость

НДС - решение в рамках Add-on, с настройкой схемы налогов, с книгами покупок/продаж. Налог на прибыль - отдельное типовое проектное решение, построенное на функциональности FI-SL. Объяснять как настраивать?

в общих чертах если можно

По настройке НДС есть официальная документация - refer to SAP Service Marketplace. А ТПР по учету налога на прибыль - получаете транспорты с ТПР, устанавливаете в соответствии с нотами, потом набираете spro - и на ближайшие пару месяцев Вам обсепечена интереснейшая и увлекательная работа. Если серьезно, то тоже есть документация. Там же.

на самом деле надо было понять, как она настроена. Спасибо за ответ.

Понять как НАСТРАИВАТЬ - значит понять как НАСТРОЕНО. В документации указано первое. А вам нужно второе. Делайте выводы.

А что - можно настроить не так как в документации?
Хорошо, упрощу вопрос - может ли быть, что налоговый учет привязан к бухгалтерскому?

Можно настроить так, как нравится. Для этого есть ABAP и открытая система. Самый трудоемкий способ с точки зрения методологии, внедрения и поддержки.
Можно настроить "единый" бухгалтерский и налоговый учет, если получится совместить их методологически. Вряд ли это вам удастся.
Можно воспользоваться стандартными рекомендациями SAP и не париться с методологией и проблемами настройки - грабли уже известны.

спасибо!

Скорее лучше сделать наоборот. Потому что получатели налоговой отчетности могут обеспечить гораздо больше неприятностей, чем пользователи бухгалтерской. Поэтому открываете НК, и по каждому абзацу создаете один или несколько счетов ГК. В процессе продуктивного запуска объясняете юзерам, что кто будет проводить заготовку рогов и копыт на производство металлопроката, новогодний банкет в бухгалтерии - на расходы по организации услуг контейнерных перевозок, тот будет общаться с прокурором лично. Потом отчетом собираете декларацию.
Перед тем, как заниматься настройками типового решения по налогу на прибыль, вам предстоит разобрать весь ваш бухгалтерский учет с точки зрения требований НК. Это самая долгая работа - определить, с каких счетов при каких прочих условиях вы будете тащить данные в декларацию, с каких - не будете.