Гм....на примере? ну вот вам пример:
1.Сделали заказ(сформировался документ облиго) на 1000р  и 10 ед материала
2.Внесли изменения в заказ(например за единицу материала не 10р, а 11 или материал поменяли на другой) 
3.Сделали счет фактуру на  200р
4.Сделали еще одну фактуру на 600р
Так вот, если мы теперь зайдем в документ облиго мы увидим  что все эти изменения отражены в нем....для каждого изменения будет своя отдельная позиция в документе облиго
1000    - оригинал
100      - оригинал(изменение стоимости ед. материала)
-200     - сокращение(акцепт счета-фактуры)
-600     - сокращение(акцепт счета-фактуры)
Итого: 300р осталось
то есть по сути обновление на базе периодов позволяет пользователю получить полную картину всех изменений облиго. А в случае обновления на базе годов изменения просто суммируются.
Ну и еще в случае обновления на базе периодов, придется видимо осуществлять перенос открытых облиго из прошлого  года в текущий.Так что если решитесь перейти на PBET будьте готовы к тому что документ облиго будет расти пропорционально количеству его изменений 

 ....и еще...неизвестно будет ли возможность вернуться обратно на обновление по годам...