Как уйти от этой ситуации ?

Вопрос конкретизируй. А то не совсем понятно в чем проблем.

В очереди запросов появились запросы с зелёной молнией рядом с порядковым номером. При щелчке на этом значке возникало приведённое выше сообщение . Получается запросы преобрели некий статус , что TMS не видит их в транспортной директории и требует их импорт из некоей другой транспортной группы .

À ââåðõó ïîÿâèëàñü àíàëîãè÷íàÿ êíîïî÷êà - "ìîëíèÿ" (âûðàâíèâàíèå î÷åðåäè). Ùåëêàåøü è âñ¸ good.

В добавдение к предыдущему сообщению.
Если так раньше не было, - у вас возникла следущая ситуация: в резултате, например, перенастройки танспортной системы, траспортная директория системы А и транспортная директория системы Б оказались различны.
Если вас очень сильно напрягает появление этой молнии, вам необходимо настроить транспортную систему так, чтобы обе системы смотрели в одну директорию. А вообще, ежли кликать по кнопочке вверху(как советовал Barbarian), все ОК будет
И еще , читайте хелп. ТАм все найти можно, если постараться