Подскажите, как добавить отчет в дерево отчетов через SE43?

А зачем? Может быть проще в фавориты добавить?

Если действительно нужно добавить, то лучше поискать юзер-экзиты в s000. Можно непосредственно s000 модифицировать, если не боитесь, что при обновлении всё слетит и придётся вставлять свою веточку заново.