Был введен счет кредитору, потом выравнивание.

Потом Выравнивание по 97 (услуги страхования).

Потом была найдена ошибка. Отмена выравнивания по кредитору прошло, а при попытке выровнять 97 выдает: FS601 документ ХХХХХХХ не "чистый" документ выравнивания. В пояснении есть ссылка на еще один и еще один.

Необходимо дойти до последнего и начать отменять с него?

такое сообщение - свидетельствует о том, что есть последующие выравнивания, это док выравнивания не последний в "цепочке".
И - да, "раскручивать" ее нужно в обратном порядке

Немного не понятно, почему 4 документов (исходя из BSE_CLR).