[1] Почему для стандартного типа позиции NLC (в отличие от NLN) в стандарте не отмечена галка 'Партии поставки допустимы'?
(при этом для NLC присвоен тип партии поставки NC)

[2] Зачем сделали две разные настройки одного и того же {риторический вопрос}

Сбыт → Продажа → Торговые документы → Позиция торгового документа → Определение типов позиций

Оперативная логистика → Отгрузка → Поставки → Определение типов позиций для поставок

1) Можно предположить, что это галочка проверяется при создании сбытовыхз заказах, а тип позиции NLC предназначен для поставок, созданных из заказа на перемещение.
2) Эти настройки действительно хранятся в одной таблице. Но галок там много, вот видать САП и решил разделить их по принадлежности к заказам и к поставкам. Это кстати, не редкий случай, когла одна настроечная табличка в разном виде видна в разных настройках спро.

Спасибо!