Ситуация такая.
Есть ФМ, в котором бач-импут транзакции MD03. Если запускать этот ФМ в режиме тестирования с транз. SE37, то создается Заказ. А с отчета, где отрабатывает этот же ФМ, создается Заявка. В обеих случаях на вход подаются одинаковые данные.

Может кто боролся когдато с такой бодягой?

Смотреть чем заполнено (и заполнено ли вообще) поле Вид Документа в BDC таблице. Возможно оно при ручном вводе автоматом дозаполняется из постоянных значений пользователя. Хотя конечно случай забавный

Может, в ФМ есть строка типа

if sy-tcode = ...

Нет. Сам создавал ФМ.

Тогда что такое "режиме тестирования"?

Если в новой сессии запустить?
CALL FUNCTION func ...STARTING NEW TASK task name.

На вход может подаются и одинаковые данные (хотя верится с трудом), но вы убедились, что в транзакцию они тоже подаются одинаковые? А то может где-нибудь какой-нибудь default параметр застрял...