В настройке балансовой единицы

SPRO->Финансы (нов)->Глобальные параметры для балансовой единицы->Проверка и дополнение глобальных параметров -

есть настройка "Внешняя БЕ", в каких случаях устанавливается ?

Это нужно, если используется сложный системный ландшафт. В этом случае в разных системах одна и та же по бизнес-логике БЕ может называться по-разному. А через всякие ALE системы в ландшафте связываются между собой и понимают именно через Глобальную БЕ, о чем идет обмен данными.