На складе имеются материалы в особом запасе проекта (Q).
Необходимо запретить пользователю выполнить окончательный расчет и закрытие проекта, пока запас не нулевой.

Полагаю, что пользователю - бухгалтеру ВНА, осуществляющему ВВЭ и отвечающему за формирование первоначальной стоимости, необходимо контролировать при итоговом расчете нулевой запас по сальдовой ведомости в разрезе материалов и СПП на складе.

Итоговый расчет запретить не получится. А вот проект не закроется, если есть материалы под СПП. Система сругается.

В GGB0 можно написать программу для проверки запаса, я думаю.