Можно ли в цепочке переключить транзакционный куб а после вернуть назад стандартом?

да, можно!

и как ?

Пишешь 2 авап программы и вставляешь их в цепочку
Текст программ- следующий:

report ZTESTABAP.
data: ZMAIN_SUB(30) type c.
call function 'RSAPO_SWITCH_TRANS_TO_BATCH'
exporting
I_INFOCUBE = 'ZMAIN_SUB'.

и соотв.
REPORT ZSUBBATTR .
data: ZMAIN_SUB(30) type c.
call function 'RSAPO_SWITCH_BATCH_TO_TRANS'
exporting
I_INFOCUBE = 'ZMAIN_SUB'.

Enjoy!
)

вообще-то я имел в виду стандартные средства, про программы я знаю, но все равно спасибо.

Это стандартный способ. В курсе SEm210 есть.