Добрый день.

Для того, чтобы изменить цену через MR21 какие условия должны выполняться? (отсутствие движений, нулевой запас...) Или MR21 можно все время безболезненно пользоваться. Какие подводные камни в общем?

Да в принципе то никаких таких уж серьезных требований не должно быть.
Разве, что есть как я помню некоторая специфика при активированном регистре материалов, когда стоит 3 (одно/многоуровневый расчет)
А так пользуйся и сам увидишь.

Возникают проводки по операции UMB. Нужно грамотно подобрать для неё счет.

Еще возникают нюансы, если попытаться изменить цены прошлым периодом. Это все в хелпе расписано просто нужно обратить на это внимание.