Ситуация такая: создается заказ на поставку с контировкой на заказ (прописывается счет, заказ, ПФМ)
А когда уже делают счет- фактуру,то появляется еще контировка на МВЗ.
Есть предположение,что где-то привязка к виду затрат.
Если есть соображения - поделитесь, пожалуйста.

МВЗ автоматически в проводке проставляется или просто на экране поле МВЗ отображается?

автоматически

Тогда в транзакции KA02 виду затрат может быть присвоено МВЗ или в самом внутреннем заказе (просмотреть транзакция KO03)

Да нет, там тоже ничего нет. Это я уже проверяла.
Может связка тянется с ММ??

В MM точно нет ничего такого. Это или CO или FI.
Гляньте ещё настройку CO в транзакции OKB9 может там настроен автоматический выбор контировки

Посмотрите в транзакции GGB1 замещения FI или CO.