Подскажите как решить проблему.
Исходные данные. Есть заказ на поставку 4 шт материала, материал ведётся партиями, для этой позиции галка "контроль счетов на основе ПМ" отжата.

Используются счета 76* счёт кредитора, 15* перерасчетный счет, 79* счет ценовых разниц, 71* материальный счет.

Ситуация следующая, были выполнены проводки (цифры примерные, но суть та же):
Счет-фактура на 4 шт на сумму 400 руб (Д 15/К 76)
ПМ на 2 шт на сумму 200 руб (Д 71/К 15)
Счет-фактура на 1 шт на сумму 160 руб (Д 15/К 76)

После выяснилось, что последняя счет-фактура ошибочна. При попытке её сторнировать, часть суммы, а именно 40 руб просится на счёт разниц 79*, который не используется и не настроен для проводок, т.е. по счетам это выглядит так:
Д 76* на 160 руб
К 15* на 120 руб
К 79* на 40 руб

Как провести сторно последнего счета-фактуры, чтобы вся сумма (160 руб) списалась с 15-го счета.

P.S. как я понял система работает следующим образом:
после проводки ПМ на 2 штуки, остаётся недопоставка на 2 шт, которые были уже отфактурированы, расчитываем стоимость единицы материала и получаем 200/2=100 руб за штуку
После проводки ошибочного счета-фактуры получаем ситуацию при которой уже ожидается поставка 3 шт материала по цене за штуку (200+160)=360 руб и 360/3=120 руб
Таким образом при попытке выполнить сторно счета-фактуры на 1 шт на 160 руб кредитуется 15-й счет из расчета стоимости одной штуки материала (120 руб), а разница в 40 руб хочет лечь на 79* счёт.

Так вот ещё раз вопрос, как сторнировать счет-фактуру, чтобы получились проводки К 15* на 160 руб, Д 76* на 160 руб???

Не особо понятно в чем проблема.
если про входящую счет-фактуру, то сторнируется MR8M - Стронирование документа счета-фактуры

При сторно счет фактуры Вы какую дату берете?